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鱼病知识:抗菌肽分类

出处:水生动物健康评估 作者: 中国水产养殖网 2019-01-21 11:04:00
抗菌肽,因其天然的抗菌、抗病毒等活性而逐渐引起大家的重视,特别是在“耐药”频发的年代,甚至有文章描述抗菌肽有取代抗生素的潜力,今天小编给大家分享一下来源于抗菌肽数据库中对抗菌肽的分类:

1、基于合成方式分类
   天然抗菌肽可分为基因合成和非基因合成,抗菌肽数据库最初只关注于基因合成类抗菌肽,也被称为真抗菌肽。但目前一部分非基因合成类抗菌肽已经在临床上得以应用,如多粘菌素、短杆菌肽、达托霉素。
 
2、基于生物来源分类
   基于生物来源,抗菌肽分为细菌性抗菌肽、植物性抗菌肽、动物性抗菌肽。细菌性抗菌肽来源于细菌,来源于革兰氏阳性菌的抗菌肽可分为以下几类:I型,多肽链合成后发生化学性修饰,又细分为A型和B型,A型具细长结构,B型具球形结构;II型,多肽链合成后未经修饰,又细分为a、b、c、d型;III型,是具有裂解作用的大分子蛋白。来源于革兰氏阴性菌的抗菌肽称为microcins,根据分子量大小分为3种:I型(<5kDa)、II型(5-10kDa)、III型(>10kDa)。动物性抗菌肽又分为昆虫抗菌肽、两栖类抗菌肽、鱼类抗菌肽、爬虫类抗菌肽、哺乳类抗菌肽,其中基于来源家族不同,研究较为广泛的是cathelicidins, defensins, histatins。
 
3、基于生物功能分类
   基于抗菌肽的生物学功能可分为以下类型:抗菌肽(2565种)、抗生物膜肽(38种)、抗甲氧西林金黄色葡萄球菌肽(138种)、抗病毒肽(186种)、抗HIV肽(109种)、抗真菌肽(1090种)、抗虫肽(103种)、抗疟肽(25种)、抗原生动物肽(4种)、抗癌/肿瘤肽(224种)、抗氧化肽(23种)、趋向肽(60种)、杀虫肽(33种)、蛋白抑制肽(28种)、杀精肽(13种)、表面固定肽(47种)、伤口愈合肽(19种)、抗毒肽(14种)、离子通道抑制肽(5种)、消炎肽(12种)。
 
4、基于肽的性能分类
   在缺乏3D结构信息时,抗菌肽基于其电荷、疏水性、氨基酸组成、长度等性能分类。基于氨基酸组成,称为富含某氨基酸抗菌肽,如Trp-rich AMPs(富含色氨酸抗菌肽)。基于电荷可分为正电、中性、负电抗菌肽。基于疏水性可分为疏水性、两性、亲水性抗菌肽。基于抗菌肽的大小(即氨基酸的数目)可分为超短抗菌肽(2-10个氨基酸)、短抗菌肽(10-24个氨基酸)、中等抗菌肽(25-50个氨基酸)、长抗菌肽(50-100个氨基酸),氨基酸个数大于100个称为抗菌蛋白。
 
5、基于共价键模式分类
基于共价键模式分类是抗菌肽分类的通用系统,可分为以下4类:
(1)UCLL型:线性单一肽链或者两个不通过共价键连接的线性肽
(2)UCSS型:支链-支链相连肽
(3)UCSB型:支链-主链相连多肽
(4)UCBB型:多肽N端和C端相连成一环状肽
 
6、基于3D结构分类
   基于抗菌肽二级结构可分为α,β,αβ和 non-αβ 4种类型,α螺旋结构、β折叠结构、α螺旋+β折叠结构、无α螺旋和β折叠结构。
 
7、基于分子靶点分类
   基于抗菌肽作用的分子靶点,可分为作用于细胞表面抗菌肽、作用于细胞内抗菌肽。按此在新窗口浏览图片
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发布人:汪杨
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