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中科院海洋所破译对虾基因组并获国际首个高质量对虾基因组参考图谱

2019-01-22 23:08:00  中国水产养殖网  出处:中国新闻网        浏览量: 3077 次 我要评论
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对虾基因组重测序。中科院海洋所提供

  中新网青岛1月22日电 (记者 杨兵 胡耀杰)中科院海洋所22日发布消息称,该所相建海和李富花研究组主导,与国内外多家单位共同合作,历时十年成功破译了凡纳滨对虾基因组,获得世界上首个高质量的对虾基因组参考图谱,为甲壳动物研究及对虾基因组育种和分子改良提供了重要理论支撑。

  据介绍,甲壳动物和昆虫是节肢动物门中的两大门类,已有超过6万种甲壳动物被报导。十足目甲壳动物囊括了大量重要的水产经济物种,如虾、蟹、龙虾等,而凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)作为四大养殖虾类之首,其年产量达416万吨,具有非常重要的经济价值。然而,由于种质资源匮乏,中国对虾养殖单位每年需从国外大量引进。
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凡纳滨对虾基因组图谱。中科院海洋所提供

  对虾基因组是世界上公认的高复杂基因组,阻碍了多个国际科研机构的研究步伐。在该研究中,科研人员尝试了从一代到三代的各种测序平台以及各种组装软件,通过分析发现,以1-6碱基为单位多次重复的简单串联序列(SSR)占对虾基因组的23.93%以上,是目前已测基因组物种中含量最高的,这也是对虾基因组高复杂性的根本原因。

  据悉,对虾基因组的发表为甲壳动物底栖适应和蜕皮等研究提供了重要的理论基础和数据支撑,同时也为对虾基因组育种和分子改良工作提供了重要的基础平台。该研究得到国家863计划、国家自然科学基金、青岛海洋科学与技术试点国家实验室“蓝色生命”以及实验室海洋生物学重点实验室重大成果支持计划等项目资助。(完)

 
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